Vůně trusu je spojena hlavně s hnilobnými procesy, které ovlivňují aminokyseliny uniklé ze střevní absorpce. Tyto živiny jsou ve skutečnosti zachyceny bakteriemi tlustého střeva, procházejí dekarboxylačním procesem, který produkuje následující toxické aminy:
arginin → agmatin
cystin a cystein → merkaptan
histidin → histamin
lysin → kadaverin
ornitin → putrescin
tyrosin → tiratina
tryptofan → indol a skatole
Mnoho z těchto látek dodává stolici obzvláště nepříjemný zápach. Stolice se stává dost zapáchající, i když zůstávají ve střevě delší dobu, stejně jako ve výše uvedených případech malabsorpce (celiakie, pankreatická insuficience, střevní infekce, Crohnova choroba, ulcerózní kolitida, syndrom krátkého střeva, cystická fibróza, játra onemocnění žlučových cest a žaludku doprovázené hypochlorhydrií). Když je malabsorpce převážně bílkovina, pach stolice je nepříjemný, zatímco se stává štiplavým a pronikavým, když do tlustého střeva dorazí velké množství neabsorbovaných nebo špatně stravitelných cukrů a škrobů, které pak kvasí místní flórou za produkce těkavých mastných kyselin .
Vegetariánský průjem a výkaly špatně páchnou.
Výkaly s pachem ryb nebo spermií jsou charakteristické pro bacilární úplavici, choleru a obecněji pro mucorrheu.
V souhrnu je tedy vůně výkalů ovlivněna stravovacími návyky (množství bílkovin, aromatických potravin, jako je česnek nebo cibule atd.), Střevní bakteriální flórou, zdravotním stavem a konkrétními návyky (jako je kouření nebo žvýkání) Obecně platí, že konzumace malých a dobře vyvážených jídel, aniž by byla spojována velká množství „nekompatibilních“ potravin (viz disociovaná dieta), pomáhá optimalizovat trávicí procesy, snižovat výskyt poruch, jako je meteorismus a plynatost, a stolice vůně sui generis.
Jakýkoli případ, ve kterém je špatný zápach stolice doprovázen příznaky, jako je černá, deštivá nebo bledá stolice, přítomnost krve ve stejné, horečka, zimnice, silné břišní křeče, hojná přítomnost hlenu ve stolici a ztráta hmotnosti.