Je důležité odlišit akutní a chronický průjem, lokalizovat problém v tenkém nebo tlustém střevě a pochopit, zda je průjem způsoben primárním gastrointestinálním onemocněním nebo je důsledkem extraintestinálního onemocnění.
Vzhledem k různým příčinám průjmu a jeho potenciálně samo-omezující povaze by se diagnostický přístup měl lišit podle klinické anamnézy pacienta, závažnosti symptomů a dostupnosti majitele.
jsou nejčastější příčiny. V těchto případech je velmi důležitá anamnéza (kontakt s nemocnými zvířaty, známá nesnášenlivost, pobyt v kotcích, konzumace nedovařených nebo zkažených potravin). Přítomnost hlenu, živé krve, potíže a naléhavost při vyprazdňování svědčí o problému tlustého střeva , zatímco hubnutí a natrávená krev naznačují postižení tenkého střeva.
U zvířat s mírným průjmem, normální konzumací krmiva a vody, bez zvracení nebo dehydratace často stačí podpůrná péče. V případě progrese klinických příznaků s dehydratací a ztrátou chuti k jídlu jsou nutné další diagnostické testy, jako jsou testy na stolici, testy na infekční choroby a krevní testy, se zvláštní pozorností na zvířata se známkami systémových onemocnění.
Průjem u společenských zvířat souvisí s Clostridium perfringens, Clostridium difficile, Campylobacter, Salmonella a E. coli. Na druhé straně však mnoho zdravých zvířat tyto bakterie ukrývá a jejich nález nemusí nutně znamenat přítomnost klinických příznaků.
Zejména existuje zjevná korelace mezi C. perfringens a akutního hemoragického průjmu, ale není jasné, zda je přítomnost této bakterie příčinou nebo následkem v důsledku „změny střevní mikroflóry; totéž platí pro C. obtížné.
Campylobacter je naproti tomu schopen způsobit gastrointestinální symptomy zejména u mladých zvířat vystavených predisponujícím faktorům, jako je stres, přeplněnost a souběžná onemocnění.
Některé typy E-coli může způsobit střevní infekce u psů s narušeným imunitním systémem a často se účastní boxerské granulomatózní kolitidy s podobnými lézemi popsanými také u francouzského buldoka a border kolie.