Z chemického hlediska je fondaparinux syntetický pentasacharid sulfátu, jehož chemická struktura je založena na aktivní části nefrakcionovaného heparinu.
Podobně jako u jiných heparinových léků musí být fondaparinux podáván parenterálně a zejména subkutánní injekcí, aby fungoval. V některých případech však může být účinná složka také podávána intravenózně specializovaným lékařským personálem.
V Itálii je fondaparinux k dispozici v jediném léčivém přípravku s názvem Arixrtra®. Tento léčivý přípravek je ve formě injekčního roztoku připraveného k použití, který je obsažen v předplněných injekčních stříkačkách. K vydání tohoto léku je nutný lékařský předpis. opakovatelné; nicméně, protože je klasifikován jako lék třídy A, jeho náklady (určitě vysoké) mohou být uhrazeny Národním zdravotním systémem (NHS).
